Les bactéries vivent presque partout. Elles sont si courantes, en fait, que selon une estimation citée par les National Institutes of Health, le nombre de bactéries dans votre corps est dix fois plus élevé que le nombre de cellules. Alors que nous considérons souvent les bactéries comme des envahisseurs hostiles, les bactéries pathogènes – des bactéries qui nuisent à leurs hôtes – ne sont en fait qu’une petite minorité des bactéries que nous rencontrons. De nombreuses bactéries non pathogènes importantes appellent les humains chez eux.
Escherichia coli
Dans les articles d’actualité et dans la presse populaire, les mots E. coli et intoxication alimentaire sont souvent liés. Cette mauvaise réputation est presque entièrement injustifiée. Bien que certaines souches d’E. coli trouvées chez les bovins soient toxiques pour les humains, les bactéries E. coli sont en fait des résidents normaux de votre gros intestin qui ont colonisé le côlon peu après votre naissance. E. coli est la meilleure bactérie étudiée de toutes les bactéries. Son abondance, la facilité relative avec laquelle il peut être cultivé et notre connaissance approfondie de ses particularités en ont fait un favori des biologistes moléculaires et des ingénieurs en génétique du monde entier.
Bactéroïdes
Bacteroides est un genre de bactéries comprenant un certain nombre d’espèces qui sont de loin les habitants les plus abondants de vos intestins. Chaque gramme de vos selles contient des bactéries numérotées de 10 à la 11ème puissance (c’est-à-dire un dix suivi de 11 zéros), et plus d’un cinquième d’entre elles sont des Bacteroides. Avec E. coli et vos autres bactéries intestinales, Bacteroides décompose les nutriments, les met à votre disposition, consomme certains des nutriments que vous n’utilisez pas et aide à empêcher les bactéries nocives de coloniser vos intestins. Une étude réalisée en 2005 dans « Proceedings of the National Academy of Sciences » suggère qu’une modification intentionnelle du type et de la population de bactéries intestinales pourrait un jour être un moyen viable de traiter également l’obésité.
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